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初遇，缘起
- 作者的话
- 楔子
- 人物介绍
- 第一章 报仇
- 第二章 前尘了
- 第三章 初识新一，入住工藤宅
- 第四章 工藤新一少年时的冒险
- 第五章 初识黑羽快斗
- 第六章 七夕（上）
- 第七章 七夕（中）
- 第八章 七夕（下）
- 第九章 离开
- 第十章 优子的初次案件（上）
- 第十一章 优子的初次案件（中）
- 第十二章 优子的初次案件（下）
- 第十三章 重逢，再见新一
- 第十四章 杀人魔
- 第十五章 工藤新一VS怪盗基德（上）
- 第十六章 工藤新一VS怪盗基德（下）
- 第十七章 再见快斗
- 第十八章 小泉红子的预言
- 第十九章 变小的名侦探
- 第二十章 游乐园，又遇案件（上）
- 第二十一章 游乐园，又遇案件（下）
- 第二十二章 服部登场
- 第二十三章 外交官杀人事件（上）
- 第二十四章 外交官杀人事件（中）
- 第二十五章 外交官杀人事件（下）
- 第二十六章 柯南VS怪盗基德1
- 第二十七章 柯南VS怪盗基德2
- 第二十八章 柯南VS怪盗基德3
- 第二十九章 柯南VS怪盗基德4
- 第三十章 柯南VS怪盗基德5
- 第三十一章 来自优子的报复（上）
- 第三十二章 来自优子的报复（下）
- 第三十三章 灰原哀（上）
- 第三十四章 灰原哀（中）
- 第三十五章 灰原哀（下）
- 第三十六章 滑雪场，再见服部
- 第三十七章 冰与火的初遇
- 第三十八章 新出的试探
- 第三十九章 案件开始
- 第四十章 调查，和叶的请求
- 第四十一章 案件明朗，探哀暧昧升级
- 第四十二章 真相，危机降临
- 第四十三章 优子的坚持，危机仍在
- 第四十四章 绝境，绝望
- 第四十五章 结束，快斗的心
- 第四十六章 奇怪的转学生
- 第四十七章 负伤的名侦探
- 第四十八章 优子的明悟
- 第四十九章 艰难的校园祭
- 第五十章 罪恶的校园祭，新一归来
- 第五十一章 校园祭落幕，来自黑暗的报复
- 第五十二章 梦境，痛苦交织
- 第五十三章 愤怒，优子的危机
- 第五十四章 令人窒息的死亡游戏
- 第五十五章 破解暗号，终点将近
- 与剧情无关，不喜欢的可以不看
- 第五十六章 疯狂，来自地狱的召唤
- 第五十七章 营救，险境
- 第五十八章 落幕，不该遗忘的事
- 第五十九章 失望，不想再听的解释
- 第六十章 争执，各有委屈
- 第六十一章 优子的决定
- 第六十二章 餐厅里的命案（上）
- 第六十三章 餐厅里的命案（中）
- 第六十四章 餐厅里的命案（下）
- 第六十五章 山雨欲来
- 第六十六章 风平浪静
- 第六十七章 预告函，巴士危机
- 第六十八章 谜一样的乘客
- 第六十九章 瞳孔中的暗杀者
- 第七十章 快斗的生日，相伴随影
- 特别篇 儿时的回忆
- 第七十一章 惊异，分身化影！
- 第七十二章 对决，势均力敌
- 第七十三章 满月下的对决
- 第七十四章 渐近的阴霾
- 第七十五章 来自黑暗的邀请，对决将近
- 第七十六章 这样的保护，我不需要
- 第七十七章 码头对决
- 第七十八章 惊险重重
- 第七十九章 阴谋下的仁慈
- 第八十章 无忧的校园
- 第八十一章 惊艳，怀疑
- 第八十二章 你到底是谁
- 第八十三章 做他的华生
- 084 平成的福尔摩斯（Start！）
- 085 平成的福尔摩斯（Choice）
- 086 平成的福尔摩斯（Puzzle！）
- 087 平成的福尔摩斯（Carry on）
- 088 平成的福尔摩斯（stamp）
- 089 平成的福尔摩斯（Catch you）
- 090 平成的福尔摩斯（Protection）
- 091 平成的福尔摩斯（Memory）
- 092 平成的福尔摩斯（Pretend)
- 093 平成的福尔摩斯（Secret love）
- 094 平成的福尔摩斯（Quarrel）
- 095 平成的福尔摩斯（Kaito）
- 通知
- 097 平成的福尔摩斯（Request）
- 098 平成的福尔摩斯（Death）
- 099 平成的福尔摩斯（Penetralium）
- 100 平成的福尔摩斯（Murderer）
- 101 平成的福尔摩斯（Truth）
- 特典 Blue Memory
- 102 银翼的魔术师1
- 103 银翼的魔术师2
- 104 银翼的魔术师3
- 105 十年后的陌生人（上）
- 106 十年后的陌生人（下）
- 通知
- 107 永远的青梅竹马
- 108 光与影的篇章 开端
- 相约再见